南京醫(yī)科大學創(chuàng)建于1934年，時名江蘇省立醫(yī)政學院。1957年，由鎮(zhèn)江遷至南京，更名為南京醫(yī)學院。1962年，被列為全國首批六年制醫(yī)藥院校。1981年，被批準為全國首批博士、碩士學位授予單位。1993年，更名為南京醫(yī)科大學。學校是江蘇省屬重點建設(shè)高校。2015年9月，獲準成為首批教育部、國家衛(wèi)生計生委與省政府共建醫(yī)學院校。

學校設(shè)有19個學院(部)和1個獨立學院——康達學院。擁有23所附屬醫(yī)院和50多所教學醫(yī)院。學校現(xiàn)有在職教職工1700多人，其中學校編制專任教師884人。有教授212人、副教授303人，有博士生導師730人、碩士生導師2405人(含附屬醫(yī)院)。學?，F(xiàn)有中國工程院院士1名，美國國家醫(yī)學院外籍院士1名，“長江學者”特聘教授3名，“長江學者獎勵計劃”青年學者2 位，國家“萬人計劃”百千萬工程領(lǐng)軍人才1人，國家“萬人計劃”科技創(chuàng)新領(lǐng)軍人才3人，國家“萬人計劃”青年拔尖人才2人，國家百千萬人才工程7人，國家杰出青年科學基金獲得者9人，優(yōu)秀青年基金獲得者12人，國家級教學名師1人，全國優(yōu)秀教師1人，江蘇省特聘教授32人， “國家級教學團隊”3個，教育部“創(chuàng)新團隊”1個。

學?，F(xiàn)有一級學科博士學位授權(quán)點8個(生物學、基礎(chǔ)醫(yī)學、臨床醫(yī)學、口腔醫(yī)學、公共衛(wèi)生與預防醫(yī)學、藥學、特種醫(yī)學、護理學)、二級學科博士學位授權(quán)點54個、3個交叉學科博士學位授權(quán)點(臨床醫(yī)學工程、人文醫(yī)學、健康政策管理);一級學科碩士學位授權(quán)點12個、二級學科碩士學位授權(quán)點67個;博士后科研流動站7個，學位授權(quán)點已覆蓋醫(yī)學、理學、工學、管理學、法學、教育學和文學等7個學科門類;擁有3個國家重點學科、1個國家重點培育學科、28個國家臨床重點?？?、2個江蘇省一級學科重點學科、3個江蘇省一級學科重點培育學科。在全國第四輪學科評估中，我校公共衛(wèi)生與預防醫(yī)學在全國54所參評高校中獲評A+等級。臨床醫(yī)學、分子生物學與遺傳學、生物學與生物化學、神經(jīng)科學與行為學、藥理學和毒理學、免疫學、社會科學總論7個學科進入ESI全球排名前1%?；A(chǔ)醫(yī)學、臨床醫(yī)學、口腔醫(yī)學、公共衛(wèi)生與預防醫(yī)學、藥學、護理學是江蘇省高校優(yōu)勢學科。

學校設(shè)有26個本科專業(yè)和3個“5+3”本碩一體化專業(yè)。目前，在校生總數(shù)為1.7萬多人，已形成從本科生、研究生到博士后，從全日制到成人教育、留學生教育全方位、多層次的教育體系。

學?，F(xiàn)有1個國家重點實驗室、1個國家級國際聯(lián)合研究中心、4個部級重點實驗室、20個省級重點實驗室(工程中心)、2個省級協(xié)同創(chuàng)新中心。擁有國內(nèi)一流的醫(yī)學模擬教育中心(MSC)和自主學習中心以及國內(nèi)知名、省內(nèi)一流的江蘇省醫(yī)藥動物實驗基地，建有江蘇省唯一的省級衛(wèi)生政策智庫健康江蘇研究院以及省內(nèi)唯一的轉(zhuǎn)化醫(yī)學研究機構(gòu)江蘇省轉(zhuǎn)化醫(yī)學研究院。

“十二五”以來，學?？蒲兴讲粩嗵嵘?，獲得國家重點研發(fā)計劃項目(課題)，國家自然科學基金重點、重大項目，創(chuàng)新研究群體項目等國家級重大科研項目近百項。獲得國家自然科學獎等國家級成果獎4項，發(fā)表SCI論文9236篇，論文數(shù)量及論文影響因子均呈顯著增長。2018年，我校獲得291項國家自然科學基金項目資助，項目數(shù)位居獨立設(shè)置醫(yī)科大學第1位。連續(xù)多年被評為“江蘇省科技工作先進高?！?。

學校現(xiàn)已建成5門國家級精品課程，4門國家級精品資源共享課 ，有5個國家級特色專業(yè)、5個省級特色專業(yè)、4個省級品牌專業(yè)、2個國家級雙語教學示范課程;建成2個國家級實驗教學示范中心、1個國家級虛擬仿真實驗教學中心、12個省級實驗教學示范中心、19個中央和地方財政共建高校教學實驗室、有1個國家級人才培養(yǎng)模式創(chuàng)新試驗區(qū)。主編6部國家“十二五”規(guī)劃教材。學校通過教育部臨床醫(yī)學專業(yè)認證，得到8年最長認證周期。學校的招生和就業(yè)工作受到社會各界的好評，就業(yè)率始終保持在95%以上，多次被評為“江蘇省畢業(yè)生就業(yè)工作先進集體”。

學校建有江寧校區(qū)、五臺校區(qū)以及康達學院連云港校區(qū)。江寧校區(qū)位于南京市江寧區(qū)大學城，占地面積1300畝，是行政、教學和科研中心。五臺校區(qū)位于南京市鼓樓區(qū)五臺山南麓，占地120畝，是臨床教學和研究中心。學校館藏圖書文獻資料豐富，擁有中文(外文)紙質(zhì)圖書、電子圖書、全文電子期刊共一千多萬冊，是江蘇省醫(yī)學圖書中心館和高校文獻保障系統(tǒng)醫(yī)學文獻中心。學校主辦有11種學術(shù)期刊。

近年來，學校廣泛開展對外交流活動，積極與國內(nèi)外的高等院校建立形式多樣的聯(lián)系與合作。學校與美國、加拿大、澳大利亞、瑞典、日本、臺灣、香港等國家和地區(qū)的醫(yī)學院?；蚩蒲袡C構(gòu)建立了雙邊合作、學術(shù)交流關(guān)系。學校于2002年恢復招收留學生和港澳臺學生，現(xiàn)有在校留學生和港澳臺學生800多人。

進入“十三五”，全校師生醫(yī)護員工凝心聚力、統(tǒng)籌施策、開拓創(chuàng)新、改革攻堅，全面啟動實施“十三五”發(fā)展規(guī)劃，努力把學校建成國際知名、特色鮮明的高水平研究型醫(yī)科大學。